| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
|
Data corrente: |
24/01/2015 |
|
Data da última atualização: |
05/02/2024 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
O'BRIEN, A. M. P.; UTSUNOMIYA, Y. T.; MÉSZÁROS, G.; BICKHART, D. M.; LIU, G. E.; TASSEL, C. P. V.; SONSTEGARD, T. S.; SILVA, M. V. G. B.; GARCIA, J. F.; SÖLKNER, J. |
|
Afiliação: |
ANA M. PÉREZ O'BRIEN, University of Natural Resources and Life Sciences, Vienna; YURI T. UTSUNOMIYA, UNESP; GÁBOR MÉSZÁROS, University of Natural Resources and Life Sciences, Vienna; DEREK M BICKHART, ARS-USDA, USA; GEORGE E. LIU, ARS-USDA, USA; CURTIS P. VAN TASSEL, ARS-USDA, USA; TAD S. SONSTEGARD, ARS-USDA, USA; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; JOSÉ F. GARCIA, UNESP; JOHANN SÖLKNER, University of Natural Resources and Life Sciences, Vienna. |
|
Título: |
Assessing signatures of selection through variation in linkage disequilibrium between taurine and indicine cattle. |
|
Ano de publicação: |
2014 |
|
Fonte/Imprenta: |
Genetics Selection Evolution, v. 46, n. 19, 2014. |
|
Páginas: |
14 p. |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Signatures of selection are regions in the genome that have been preferentially increased in frequency and fixed in a population because of their functional importance in specific processes. These regions can be detected because of their lower genetic variability and specific regional linkage disequilibrium (LD) patterns. By comparing the differences in regional LD variation between dairy and beef cattle types, and between indicine and taurine subspecies, we aim at finding signatures of selection for production and adaptation in cattle breeds. The VarLD method was applied to compare the LD variation in the autosomal genome between breeds, including Angus and Brown Swiss, representing taurine breeds, and Nelore and Gir, representing indicine breeds. The conclusions are that VarLD method is a powerful tool to identify differences in linkage disequilibrium between cattle populations and putative signatures of selection with potential adaptive and productive importance. |
|
Palavras-Chave: |
Indicine; Minor allele frequency. |
|
Thesaurus Nal: |
Genetic improvement; Linkage disequilibrium; Taurine. |
|
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/116426/1/Cnpgl-2014-Genetics-Selection-Evolution-Assessing-signatures-of-selection.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 01864naa a2200301 a 4500
001 2006605
005 2024-02-05
008 2014 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aO'BRIEN, A. M. P.
245 $aAssessing signatures of selection through variation in linkage disequilibrium between taurine and indicine cattle.$h[electronic resource]
260 $c2014
300 $a14 p.
520 $aSignatures of selection are regions in the genome that have been preferentially increased in frequency and fixed in a population because of their functional importance in specific processes. These regions can be detected because of their lower genetic variability and specific regional linkage disequilibrium (LD) patterns. By comparing the differences in regional LD variation between dairy and beef cattle types, and between indicine and taurine subspecies, we aim at finding signatures of selection for production and adaptation in cattle breeds. The VarLD method was applied to compare the LD variation in the autosomal genome between breeds, including Angus and Brown Swiss, representing taurine breeds, and Nelore and Gir, representing indicine breeds. The conclusions are that VarLD method is a powerful tool to identify differences in linkage disequilibrium between cattle populations and putative signatures of selection with potential adaptive and productive importance.
650 $aGenetic improvement
650 $aLinkage disequilibrium
650 $aTaurine
653 $aIndicine
653 $aMinor allele frequency
700 1 $aUTSUNOMIYA, Y. T.
700 1 $aMÉSZÁROS, G.
700 1 $aBICKHART, D. M.
700 1 $aLIU, G. E.
700 1 $aTASSEL, C. P. V.
700 1 $aSONSTEGARD, T. S.
700 1 $aSILVA, M. V. G. B.
700 1 $aGARCIA, J. F.
700 1 $aSÖLKNER, J.
773 $tGenetics Selection Evolution$gv. 46, n. 19, 2014.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 55 | |
| 3. |  | SILVA, M. V. G. B.; TASSELL, C. P. V.; SONSTEGARD, T. S.; MATUKUMALLI, L.; SCHROEDER, S.; VANRADEN, P.; WIGGANS, G. Predição do valor genético total de touros da raça Holandesa por meio de mapas densos de marcadores. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA. 45., 2008, Lavras, MG. Anais... Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2008.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
|    |
| 6. | | BENAVIDES, M. V.; ECHEVARRIA, F. A. M.; SONSTEGARD, T. S.; VAN TESSEL, C. P.; GASBARRE, L. C. Genetic variability of a Bos taurus x Bos indicus cross population and validation of genomic regions influencing nematode resistance. In: SIMPOSIO DE RECURSOS GENETICOS PARA AMERICA LATINA Y EL CARIBE, 5., 2005, Montevideo, Uruguay. Resumenes... Montevideo: INIA :Facultad de Agronomía de la Universidad de la República, 2005. p. 105 SIRGEALC. Resumo 305.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
| |
| 9. | | ANDREOTE, A. P. D.; ROSÁRIO, M. F. do; LEDUR, M. C.; JORGE, E. C.; SONSTEGARD, T. S.; MATUKUMALLI, L.; COUTINHO, L. L. Identification and characterization of microRNAs expressed in chicken skeletal muscle. Genetics and Molecular Research, v. 6, n. 1, p. 1465-1479, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
| 10. | | VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; SANTIAGO, A. C.; SONSTEGARD, T. S.; OLIVEIRA, H. N.; YAMAGISHI, M. E. B.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A. Identification of genomic regions associated with backfat thickness in synthetic cattle. In: WORKSHOP DA REDE GENÔMICA ANIMAL, 1., 2009, Fortaleza. Anais... Fortaleza, Rede Genômica Animal, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 11. | | BENAVIDES, M. V.; SONSTEGARD, T. S.; KEMP, S.; MUGAMBI, J. M.; GIBSON, J. P.; BAKER, R. L.; HANOTTE, O.; MARSHALL, K.; VAN TASSELL, C. Identification of novel loci associated with gastrointestinal parasite resistance in a Red Maasai x Dorper backcross population. Plos One, v. 10, n. 4, e0122797, Apr. 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul; Embrapa Pesca e Aquicultura. |
| |
| 12. | | GARCIA, J. F.; CARMO, A. S. DO; UTSUNOMIYA, Y. T.; NEVES, H. H. DE R.; CARVALHEIRO, R.; TASSELL, C. V.; SONSTEGARD, T. S.; SILVA, M. V. G. B. How bioinformatics enables livestock applied sciences in the genomic era. In: BRAZILIAN SYMPOSIUM ON BIOINFORMATICS, 2012, Heidelberg. Proceedings... Porto Alegre: Sociedade Brasileira e Computação, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 13. | | O'BRIEN, A. M. P.; MÉSZÁROS, G.; UTSUNOMIYA, Y. T.; SONSTEGARD, T. S.; GARCIA, J. F.; TASSEL, C. P. V.; CARVALHEIRO, R.; SILVA, M. V. G. B.; SÖLKNER, J. Linkage disequilibrium levels in Bos indicus and Bos taurus cattle using medium and high density SNP chip data and different minor allele frequency distributions. Livestock Science, v. 166, p. 121-132, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
|  |
| 14. | | PORTO NETO, L. R.; SONSTEGARD, T. S.; LIU, G.; BICKHART, D.; GONDRO, C.; SILVA, M. V. G. B.; UTSUNOMIYA, Y. T.; GARCIA, J. F.; VAN TASSELL, C. P. Genomic divergence of indicine and taurine cattle identified through high-density SNP gebotyping. In: ADSA-ASAS ANNUAL MEETINGS, 2013, Indianápolis, Indiana. Abstracts... Indianápolis: [s.n.], 2013.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 16. | | O'BRIEN, A. M. P.; UTSUNOMIYA, Y. T.; MÉSZÁROS, G.; BICKHART, D. M.; LIU, G. E.; TASSEL, C. P. V.; SONSTEGARD, T. S.; SILVA, M. V. G. B.; GARCIA, J. F.; SÖLKNER, J. Assessing signatures of selection through variation in linkage disequilibrium between taurine and indicine cattle. Genetics Selection Evolution, v. 46, n. 19, 2014. 14 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
| 17. | | MIYATA, M.; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L.; MARTINEZ, M. L.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B. da; CAMPOS, A. L.; SONSTEGARD, T. S.; ROSÁRIO, M. F. do; REGITANO, L. C. de A. Quantitative trait loci (QTL) mapping for growth traits on bovine chromosome 14. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 30, n. 2, p. 364-369, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite; Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 18. | | MIYATA, M.; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L.; MARTINEZ. M. L.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; CAMPOS, A. L.; SONSTEGARD, T. S.; REGITANO, L. C. de A. Caracterização genética de uma população experimental F2 usando marcadores moleculares no cromossomo 14 ( BTA 14) de bovinos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA , 51., 2005, Águas de Lindóia. Lindóia: SBG, 2005. p. 364| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| 19. | | MYTATA, M.; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L.; MARTINEZ, M. L.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B. da; CAMPOS, A. L.; SONSTEGARD, T. S.; REGITANO, L. C. de A. Mapeamento de QTLS para peso ao nascimento no cromossomo 14 de bovinos In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 42., 2005, Goiânia. A Produção animal e o foco no agronegócio: anais. Goiânia: SBZ, 2005. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
|  |
| 20. | | GASPARIN, G.; MIYATA, M.; COUTINHO, M. L.; MARTINEZ, M. L.; TEODORO, R. L.; FURLONG, J.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; SONSTEGARD, T. S.; REGITANO, L. C. de A. Mapping of quantitative trait loci controlling tick [Riphicephalus (Boophilus) microplus] resistance on bovine chromosomes 5, 7, and 14. Animal Genetics, v. 38, n. 5, p. 453-459, oct. 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
| |
| Registros recuperados : 55 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
